- [ تعرٌف على ] شجرة تطور السلالات
- [ حكمــــــة ] قال الحسن البصري رحمه الله تعالى : " إنما الفقيه : الزاهدُ في الدنيا ، الراغبُ في الآخرة ، البصيرُ بدينه ، المداومُ على عبادة ربه ، الورعُ ، الكافُّ عن أعراض المسلمين ، العفيفُ عن أموالهم ، الناصحُ لهم ".
- [ تعرٌف على ] عزل صوتي
- [ وسطاء عقاريين السعودية ] عبدالكريم خالد محمد السيف ... الرياض ... منطقة الرياض
- [ خذها قاعدة ] إن أخطاء الحياة لا ينبغي أن تصحح على حساب الأبرياء الذين لم يرتكبوها. - عبد الوهاب مطاوع
- [ متاجر السعودية ] سلوشن ... جدة ... منطقة مكة المكرمة
- [ صيدليات السعودية ] صيدلية الدواء رقم 127
- [ فنادق السعودية ] مركز العقبة للشقق المفروشة
- [ تعرٌف على ] حزب العمال الألماني
- [ وسطاء عقاريين السعودية ] بندر بخيت عيد الجهني ... المدينه المنوره ... منطقة المدينة المنورة
- [ وسطاء عقاريين السعودية ] جارالله سعد جارالله التميمي ... حائل ... منطقة حائل
- [ تعرٌف على ] غاز (كانساس)
- [ تعرٌف على ] العلاقات البيروفية النيكاراغوية
- [ تعرٌف على ] بابسيا
- [ مقاولون السعودية ] الشركة السعودية اللبنانية للإنشاءات الحديثة
- [ الصحة الجنسية ] للرجال فقط.. 4 طرق علاجية وأدوية لزيادة الرغبة الجنسية عند الرجال.. ما هي؟
- [ وسطاء عقاريين السعودية ] عبيد بن شجاع بن عبيد الحربي ... بريده ... منطقة القصيم
- [ تعرٌف على ] الدولة الأموية في الأندلس
- [ مقاولون السعودية ] شركة لمار العربية المحدودة
- [ وسطاء عقاريين السعودية ] حاتم محمد مسلم الحربي ... الرياض ... منطقة الرياض
- [ محامون السعودية ] مكتب نضال محمد عطا للمحاماة
- [ الخدمات و تدريب الأفراد والمؤسسات. قطر ] مركز نبع السعادة للتمنية البشرية
- [ وسطاء عقاريين السعودية ] عبيد عبدالرحمن بن عثمان الحارثي ... مكه المكرمه ... منطقة مكة المكرمة
- [ متاجر السعودية ] هافلود ... جدة ... منطقة مكة المكرمة
- [ وسطاء عقاريين السعودية ] سراج حسن محمدصالح البخارى ... جدة ... منطقة مكة المكرمة
- [ فن الكتابة والتعبير ] 4 نماذج لموضوع تعبير عن الوقت
- [ مقاهي السعودية ] كورال كافيه ( قهوة و معسل )
- [ شركات مقاولات السعودية ] مؤسسة مسار الصعب العقارية ... الرياض ... الرياض
- [ تعرٌف على ] مايومي تاناكا
- [ وسطاء عقاريين السعودية ] مهدي عبدالله عايض ال دعيرم ... خميس مشيط ... منطقة عسير
- [ مبيعات وخدمات تأجير السعودية ] الغيث للعقارات
- [ وسطاء عقاريين السعودية ] ماجد عبدالله سعود الغامدي ... جدة ... منطقة مكة المكرمة
- [ تعرٌف على ] العمران (تونس)
- [ تعرٌف على ] الترويج للخرافات والرموز القومية
- [ وسطاء عقاريين السعودية ] احمد عبدالله ضيف الله الغامدي ... بني كبير ... منطقة الباحة
- [ وزارات وهيئات حكومية السعودية ] مدرسة ابو يوسف
- [ متاجر السعودية ] عطور رسوخ ... الرياض ... منطقة الرياض
- [ محامين السعودية ] صالح جمعان على القارحى ... مكة المكرمة
- [ تعرٌف على ] الراهب ذو القبضة الحديدية
- [ وزارات وهيئات حكومية السعودية ] الأرطاوى الجديد
- [ وسطاء عقاريين السعودية ] ناصر مسعود بن ناصر القحطاني ... الدمام ... المنطقة الشرقية
- [ المركبات الامارات ] ورشة النحاس لميكانيك السيارات فرع 1 ... الشارقة
- [ محامين السعودية ] آيات نزار محمد عاشور ... جدة
- [ تعرٌف على ] كاريزو سبرينغز
- [ تعرٌف على ] منشط السطح الحيوي
- [ تعرٌف على ] الحكومة الجزائرية المؤقتة
- [ وسطاء عقاريين السعودية ] خليل صالح علي المالكي ... الرياض ... منطقة الرياض
- [ وسطاء عقاريين السعودية ] باسم علي بن احمد الغامدي ... جدة ... منطقة مكة المكرمة
- [ مقاولون السعودية ] الشركة السعودية لتجهيز المقاولين
- [ وسطاء عقاريين السعودية ] مكتب عقارات الجبيل ... الجبيل ... المنطقة الشرقية
- [ تعرٌف على ] المتحف الإسلامي (القدس)
- [ سياحة وترفيه الامارات ] بيج شوت للمقاولات الرياضية مكتب دبي ... دبي
- [ تعرٌف على ] معلقة امرئ القيس
- [ تعرٌف على ] حطين (قرية)
- [ مقاهي السعودية ] كرك الجواهره
- [ وسطاء عقاريين السعودية ] غرمان على محمد الشهري ... تبوك ... منطقة تبوك
- [ تعرٌف على ] مطار منيسترو بيستاريني الدولي
- [ حكمــــــة ] قال صعصعة بن صوحان لابن أخيه : إذا لقيت المؤمن فخالطه، وإذا لقيت الفاجر فخالفه، ودينك فلا تكلمنّه .
- [ تعرٌف على ] نادي برث
- [ تعرٌف على ] الدين في السودان
- [ تعرٌف على ] العلاقات الإسرائيلية الناميبية
- [ شركات طبية السعودية ] شركة جيل الادارة الحديثة للتجارة ... جدة
- [ تعرٌف على ] متلازمة كوشر ديبريه سيميالجين
- [ وسطاء عقاريين السعودية ] سعد مهدي مشرع الاكلبي ... بيشه ... منطقة عسير
- [ متاجر السعودية ] دوبا ارت ... الرياض ... منطقة الرياض
- [ صيدليات السعودية ] صيدلية روعة حياتي
- [ متاجر السعودية ] متجر سوق شامل ... الطائف ... منطقة مكة المكرمة
- [ تعرٌف على ] عبد القادر الجندي
- [ تعرٌف على ] نهر اسكندر
- [ تعرٌف على ] حمص بطحينة
- [ تعرٌف على ] متحكم صغري
- [ متاجر السعودية ] روافي ... جيزان ... منطقة جازان
- [ شركات مقاولات السعودية ] مؤسسة اشراقة البيان للمقاولات ... الرياض ... الرياض
- [ وسطاء عقاريين السعودية ] عمر مبارك بن مطيع العلوي ... الحمراء ... منطقة المدينة المنورة
- [ وسطاء عقاريين السعودية ] سيف سياف بن بداح الشهراني ... الدمام ... المنطقة الشرقية
- [ تعرٌف على ] سترابو
- [ حديث شريف ] [ 202 ] حدثنا عبدان قال أخبرنا عبد الله قال أخبرنا الأوزاعي عن يحيى عن أبي سلمة عن جعفر بن عمرو عن أبيه قال رأيت النبي صلى الله عليه وسلم يمسح على عمامته وتابعه معمر عن يحيى عن أبي سلمة عن عمرو قال رأيت النبي صلى الله عليه وسلم
- [ وسطاء عقاريين السعودية ] مكتب عبدالرحمن عبدالله بن عبدالرحمن الحجيلان للخدمات العقارية ... بريده ... منطقة القصيم
- [ تعرٌف على ] أنا يقظ (منظمة تونسية)
- [ خذها قاعدة ] الدموع دماء الروح. - مصطفى صادق الرافعي
- [ متاجر السعودية ] قآف ... الرياض ... منطقة الرياض
- [ تعرٌف على ] مفونة (مدونة مرئية)
- [ اغذية السعودية ] مؤسسة سالم يسلم بازهير
- [ وسطاء عقاريين السعودية ] محمد علي عبدالله الشهري ... خميس مشيط ... منطقة عسير
- [ خدمات السعودية ] رابط تسجيل الحرس الوطني 1445 بوابة التوظيف الحرس الوطني
- [ تعرٌف على ] المشاع الإبداعي
- [ تعرٌف على ] العلاقات الجزائرية الإريترية
- [ التوكل والتواكل ] قال التوكل: أنا ذاهب لأعمل، فقال النجاح: وأنا معك.وقال التواكل: وأنا قاعد لأرتاح، فقال البؤس: وأنا معك.
- [ مقاولون السعودية ] شركة قارى للمقاولات
- [ تعرٌف على ] ميلينكو بانتيتش
- [ تعرٌف على ] تجميد الأجنة
- [ وسطاء عقاريين السعودية ] حاتم مشهور احمد الغامدي ... جدة ... منطقة مكة المكرمة
- [ وسطاء عقاريين السعودية ] ايوب عوض سليم الحربي ... بريده ... منطقة القصيم
- [ تعرٌف على ] شتلاند
- [ وسطاء عقاريين السعودية ] ساره ناصر بن فهد العقيل ... الظهران ... المنطقة الشرقية
- [ مؤسسات البحرين ] شركة المعهد الوطني للتدريب الصناعي ش.م.ب (مقفلة) ... المحرق
- [ اعلان السعودية ] وكالة ريزلتس للإعلان
- [ متاجر السعودية ] مايكروبليدنغ عفراء الربيش ... بريدة ... منطقة القصيم
- [ تعرٌف على ] الدوري الإيطالي 1906
- [ الحج والعمرة ] حكم الجمع بين طواف الإفاضة والوداع
- شركة نقل اثاث بالرياض|ظواهر الخليج
- تفسير حلم رؤية القضيب أو العضو الذكري في المنام لابن سيرين
- سؤال وجواب | هل يجوز للرجل حلق شعر المؤخرة؟ وهل هناك طريقة محددة لذلك ؟
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- تفسير حلم رؤية الميت يشكو من ضرسه في المنام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
- الفضاء اللوني (ص ش ض) و (ص ش ق) الاستخدام
[ تعرٌف على ] شجرة تطور السلالات # أخر تحديث اليوم 2024/05/16
تم النشر اليوم 2024/05/16 | شجرة تطور السلالات
التاريخ
نشأت فكرة “شجرة الحياة” من المفاهيم القديمة للتعاقب السلّمي للكائنات الحيّة من الأشكال السفلى للحياة إلى الأشكال العليا (كما في سلسلة الكينونة العظمى، أو سلسلة الوجود). تتضمن التصوّرات المبكّرة لشجرة الحياة «المتفرّعة» أيضاً «مخططًا قديمًا» يوضّح العلاقات الجيولوجية بين النباتات والحيوانات تمّ وضعه من قبل إدوارد هيتشكوك في كتابه الجيولوجيا البسيطة (الذي نشر في طبعته الأولى: 1840). قام تشارلز داروين (1859) أيضًا بوضع واحد من الرسوم التوضيحية الأولى ودَعَمَ مفهوم «شجرة التطوّر» وذلك في كتابه «أصل الأنواع». لا يزال علماء الأحياء التطوّرية -بعد أكثر من قرن من الزمان على نشر الكتاب- يستخدمون المخطّطات الشجريّة لتصوير التطوّر، لأنّها تنقل المفهوم القائل بأنّ التكاثر يحدث من خلال التقسيم التكيفي وشبه العشوائي للسلالات بفعّاليّة عالية. أصبح تصنيف الأنواع أقل جموداً وأكثر ديناميكية مع مرور الزمن. مصطلح phylogenetic «متعلق بتَطَوُّرِ السُّلاَلاَت»، أو phylogeny «علمُ تَطَوُّرِ السُّلاَلاَت»، مشتق من الكلمتين اليونانيتين القديمتين φῦλονالتي تلفظ (phûlon)، بمعنى «العرق، والنسب»، و γένεσις التي تلفظ (génesis)، بمعنى «الأصل، المصدر».
حدود تحليل تطور السلالات
قد توفر الأشجار التطورية، والمنتجة على أساس الجينات المتسلسلة أو البيانات الجينية في أنواع مختلفة، رؤية تطورية. لكن لهذه التحليلات حدود أو قيود مهمة. وهناك أمر بالغ الأهمية، وهو كون هذه الأشجار التطورية المتولدة غير صحيحة بالضرورة –فهي لا تمثل بالضرورة التاريخ التطوري للأصانيف المشمولة بدقة بالغة. وكما هو الحال مع أي نتيجة علمية، فهي قابلة للدحض من خلال إجراء مزيد من الدراسات (على سبيل المثال: جمع بيانات إضافية وتحليل البيانات الموجودة باستخدام أساليب محسنة). وربما تكون البيانات التي نستند إليها مشوشة. فقد يحدث اختلاطٌ في التحليل نتيجة إعادة التركيب الجيني أو نقل الجينات الأفقي أو التهجين بين الأنواع التي لم تكن قريبة على شجرة التطور قبل حدوث التهجين. وقد يحدث هذا الاختلاط بسبب التطور التقاربي أو التسلسل المحفوظ.
وهناك أيضاً مشاكلٌ عند إجراء تحليل على نوع واحد من السمات، مثل مورثة أو بروتين واحد، أو عند التحليل المورفولوجي. ويحدث ذلك لأن أشجار تطور السلالات التي يتم بناؤها من مصدر بيانات آخر غير ذي صلة تختلف غالباً عن الأولى. وبالتالي هناك حاجة ماسة إلى أخذ الحيطة والحذر عند استنتاج علاقات تطور السلالات بين الأنواع. وينطبق ذلك بشكل كبير على المواد الوراثية التي تخضع لنقل الجينات الجانبي وتخليق توافقات جينية جديدة، فقد تمتلك الأنماط الفردانية المختلفة تواريخَ مختلفة أيضاً. في هذه الأنواع من التحليل، تكون الشجرة الناتجة عن تحليل نسبي لجين واحد بمثابة إحصاء وتقديرٍ لتاريخ تطور الجينات (أي شجرة الجينات) وليست لتاريخ تطور الأصناف (أي شجرة الأنواع) التي تم أخذ عينات منها. لكن من الناحية المثالية، يجب أن يكون كلاهما قريباً جداً من الآخر. ولهذا السبب، تستخدم دراسات تطور السلالات عموماً مجموعة من الجينات التي تأتي من مصادر جينية مختلفة (على سبيل المثال: من الميتوكوندريا أو البلاستيد مقابل الجينوم النووي)، أو الجينات التي من المتوقع أن تتطور في ظل أنظمة انتقائية مختلفة، وبالتالي فمن غير المرجح أن ينتج تجانس التقويم والشكل (تنادد خاطئ) عن الانتقاء الطبيعي.
الأنواع
الشجرة ذات الجذر (الأصل) المشترك
الشجرة ذات الأصل المشترك (انظر الرسومات في الأعلى) هي شجرة موجّهة ذات نقطة التقاء فريدة -الجذر- والتي تقابل السلف المشترك الأوّل الذي (عادةً ما يتم اعتباره) الأصل المشترك الأحدث لجميع الكيانات الحيّة الموجودة على فروع وأوراق الشجرة التطوريّة. لا تملك عقدة الأصل المشترك عقدة أصلية، ولكنها بمثابة الأصل لجميع العقد الأخرى في الشجرة التطوّريّة. وبالتالي فإنّ الجذر هو عقدة من الدرجة 2 بينما العقد الداخلية الأخرى لديها درجة لا تقل عن 3 (حيث تشير «درجة» هنا إلى العدد الإجمالي للخطوط الواردة والصادرة للعقدة). تتمثّل الطريقة الأكثر شيوعًا لوضع الجذر (الأصل) للشجرة التطوّريّة باستخدام مجموعة خارجية غير مثيرة للجدل بمعنى أن تكون قريبة بدرجة كافية للسماح بالاستدلال عن طريق بيانات السمات أو التسلسل الجزيئي، ولكن بالمقابل بعيدة بدرجة كافية لتكون مجموعة خارجية واضحة. شجرة التطور بلا جذر (أصل) مشترك
توضّح الأشجار التي لا تحوي على جذر (أصل) مشترك العلاقة بين العقد دون وضع افتراضات حول نسبها. فهذا النوع من أشجار التطور لا يتطلّب أن يكون الأصل معروفًا أو مستنتجًا. يمكن دائمًا أن تنتج الأشجار التي لا تحوي أصلاً مشتركاً عن الأشجار ذات الأصل المشترك بحذف الأصل. لكن، وعلى النقيض من ذلك، فإنّ استنباط الأصل لشجرة لا تملك أصلاً مشتركاً يتطلّب بعض الوسائل لتحديده. ويتمّ ذلك عادةً عن طريق تضمين مجموعة خارجيّة في بيانات الإدخال وبذلك يكون الأصل بين المجموعة الخارجية وباقي الأصناف الموجودة في الشجرة بالضرورة، أو عن طريق تقديم افتراضات إضافيّة حول المعدّلات النسبية للتطور في كلّ فرع، مثل التطبيق فرضيّة الساعة الجزيئية. أنواع خاصة من أشجار تطور السلالات
إن الرسم الشجري هو اسم عام للشجرة، سواء أكانت شجرة سلالات تطورية أم لا، وبالتالي هو اسم عامٌ أيضاً للتمثيل البياني لشجرة تطور السلالات.
يمثل مخطط النسل نمطاً تفرعياً فحسب. أي أن امتدادات فروعه لا تمثل زمناً أو مقداراً نسبياً من تغير سمة ما، كما أن العقد الداخلية لا تمثل أسلافاً. أما الـ phylogram، فهي عبارة عن شجرة تطور السلالات التي تملك امتدادات فرعية تتناسب مع مقدار تغير سمة ما. والكرونوغرام عبارة عن شجرة تطور السلالات التي تمثل الزمن بوضوح خلال امتداداتها الفرعية. يُعد مخطط المغزل (والذي يُسمى غالباً رسم روميوجرام على اسم عالم الحفريات الأمريكي ألفريد رومر) تمثيلاً لتطور ووفرة الأصناف المختلفة عبر الزمن، ولكنه ليس شجرة تطورية. أما Dahlgrenogram فهو رسم بياني يمثل مقطعاً عرضياً من شجرة تطور السلالات. وهناك شبكة تطور السلالات، والتي لا تعني بالضرورة شجرة تطور، بل هي رسم بياني أكثر عمومية، أو رسم بياني لا حلقي موجه في الشبكات ذات الجذور. وتُستخدم للتغلب على بعض القيود الملازمة للأشجار.
بناء شجرة تطور السلالات
تُنشأ أشجار تطور السلالات المكونة من عدد غير بديهي من تسلسل المدخلات باستخدام أساليب علم تطور السلالات الحسابي. تعتبر أساليب مصفوفة المسافة، مثل الارتباط المتجاور أو طريقة UPGMA، التي تحسب المسافة الجينية من تراصف السلسلة المتعدد أبسط الطرق من ناحية التنفيذ. ولكنها لا تستند على نموذج تطوري. تقوم العديد من أساليب تراصف التسلسل، كبرنامج كلوستال مثلاً، بإنشاء أشجار تطور السلالات باستخدام الخوارزميات الأكثر بساطة (أي تلك المستندة إلى المسافة) لإنشاء هذه الأشجار. وهناك طريقة أخرى بسيطة لحساب شجرة تطور السلالات، والتي تدعى الاقتصاد الأقصى أو Maximum Parismony. ولكنها تشتمل على نموذجٍ ضمني للتطور. تستخدم الأساليب الأكثر تقدماً معيار الأمثلية لتقدير الاحتمال، غالباً عن طريق استدلال بايزي، وتطبق نموذجاً واضحاً للتطور لتقدير شجرة تطور السلالات. إن تحديد شجرة التطور المثلى باستخدام العديد من هذه التقنيات هو مسألة NP صعبة. لذلك تُستخدم طرق الاستثمال والحدس المهني جنباً إلى جنب مع وظائف تصحيح الشجرة لتحديد إن كانت الشجرة جيدة ومناسبة للبيانات. يمكن تقييم أساليب بناء الأشجار على أساس عدة معايير: الكفاءة (كم من الوقت يستغرق حساب الإجابة؟ وكم الذاكرة التي تحتاجها؟)
الطاقة (هل تستخدم البيانات استخداماً جيداً، أم تُهدر المعلومات؟)
الاتساق (هل سنحصل على نفس الإجابة مراراً وتكراراً إن حصلنا في كل مرة على بيانات مختلفة لنفس النموذج؟)
القوة (هل تتعامل بشكل جيد مع الانتهاكات التي تتعارض مع افتراضات النموذج الأساسي؟)
قابلية الدحض (هل تنبهنا عندما يكون استخدامها غير مجدٍ؟ أي عند انتهاك الافتراضات؟)
حصلت تقنيات بناء أشجار التطور على اهتمام علماء الرياضيات. وبالإمكان أيضاً بناء الأشجار باستخدام نظرية T.
شرح مبسط
شجرة المَحْتِد (بالإنجليزية: phylogenetic tree) أو شجرة التطور هي عبارة عن شجرة تظهر العلاقات التطورية بين مختلف الأنواع الحيوية أو مختلف الكيانات الحية التي يعتقد بأنها تمتلك أصلاً مشتركاً.[1][2][3] تمثل كل عقدة مع تفرعاتها في شجرة المحتد السلف المشترك الأحدث most recent common ancestor لما يتفرع عنه، وأطوال الفروع تمثل تقديرات زمنية. كل عقدة تدعى وحدة أصنوفية taxonomic unit. العقد الداخلية تدعى عادة عقد أصنوفية افتراضية (HTUs) لأنها لا يمكن ملاحظتها بشكل مباشر.